(一)治療
由于曲霉球的自然病程難以預計，不同處理措施(不用藥、內科藥物治療、外科切除)的指征頗多爭議。除疾病本身外，治療措施尚應結合基礎疾病綜合考慮，因此治療應當個(gè)體化。無(wú)癥狀或癥狀輕微者可進(jìn)行醫學(xué)觀(guān)察。有癥狀、但不適宜或拒絕手術(shù)者可試用藥物治療。據認為現有抗真菌藥物中僅有兩性霉素B和伊曲康唑有效。前者亦有人推薦采用空洞內注射療法。手術(shù)切除是惟一根治治療，適用于反復咯血或存在影響預后的危險因素時(shí)。據報道，圍術(shù)期應用兩性霉素B可減少支氣管胸膜瘺等并發(fā)癥的發(fā)生。倘若患者肺功能受損不能勝任手術(shù)時(shí)，為控制大咯血，支氣管動(dòng)脈栓塞是非常有效的治療，但遠期療效尚欠理想。有人稱(chēng)放射治療促使曲霉球周?chē)荛]塞有助于止血，但未得到公認。
(二)預后
5%～10%曲霉球病人因大咯血致死。然而這些病人中大多數，其基礎疾病是影響生存的最重要因素。