阿米巴結腸炎的潛伏期長(cháng)短不一，1～2周或數月以上?？梢蚴橙氲陌覕盗?、致病力以及機體抵抗力強弱不同，而出現不同的臨床表現。
1.無(wú)癥狀型 主要指那些阿米巴包囊攜帶者，多因普查發(fā)現，這些人由于癥狀輕微，常為病人所忽略。馬鞍山市防疫站曾報道1166例阿米巴原蟲(chóng)陽(yáng)性者中22.7%為無(wú)癥狀型。這些病人為本病重要的傳染源。
2.阿米巴腸炎 和普通腸炎類(lèi)似，病人可有腹痛腹瀉，糞便不成形或稀便，混有黏液和未消化的食物，臭味較大。
3.阿米巴痢疾 和細菌性痢疾相似，但中毒癥狀較輕。病人可發(fā)熱38℃左右，腹痛，腹瀉，一天數次到10余次。大便呈血性黏液便，或糞便與血分開(kāi)，有時(shí)可完全為血性便。若次數不多則糞便為暗紅色或果醬樣，奇臭。
在病人的新鮮糞便中，特別是在血性黏液處仔細尋找阿米巴原蟲(chóng)，一旦找到了活動(dòng)的吞噬有紅細胞的溶組織阿米巴滋養體，即可確診。一次未找到，應重復多次檢查并爭取做細菌及阿米巴培養。鏡檢時(shí)應注意保溫，否則阿米巴滋養體不活動(dòng)，不易和巨噬細胞區別。乙狀結腸鏡檢查對診斷，特別是鑒別診斷很有幫助。急性期可看到其燒瓶樣潰瘍，潰瘍間黏膜正常。慢性期可看到腸黏膜增生肥厚、肉芽腫及息肉等，可在病變處取活體組織送病理檢查，進(jìn)一步確定其性質(zhì)。

阿米巴結腸炎應與急、慢性腸炎，急、慢性菌痢，非特異性潰瘍性結腸炎，結腸癌等相鑒別。最主要的是糞便檢查和乙狀結腸鏡檢查。還應與其他寄生蟲(chóng)引起的腸炎表現相鑒別。如血吸蟲(chóng)病人，可有腹痛腹瀉的癥狀，乙狀鏡檢查可看到腸黏膜上散在有黃色小顆粒，取活組織可查到血吸蟲(chóng)卵。蘭氏賈第鞭毛蟲(chóng)寄生在小腸中，可引起腹痛腹瀉癥狀，大便中可找到該蟲(chóng)的包囊和滋養體，如做十二指腸引流，檢查引流液則陽(yáng)性率更高。過(guò)去多年來(lái)認為，寄生在人結腸中的脆雙核阿米巴是不致病的，但近年來(lái)國內外均有人提出，脆雙核阿米巴可以使某些人出現胃腸道癥狀，以腹痛腹瀉最為多見(jiàn)。大便每天2～4次，呈糊狀，也可成形，結腸黏膜無(wú)明顯的病理變化。至今未證實(shí)它有包囊，因此感染途徑仍不清楚，有人認為可能通過(guò)蟯蟲(chóng)卵或幼蟲(chóng)而感染到人體。此問(wèn)題值得今后進(jìn)一步研究。脆雙核阿米巴滋養體較小，直徑3.5～12μm，鐵蘇木精染色可看到有2個(gè)核，不難與溶組織阿米巴滋養體相區別。