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新研究揭示肝母細胞瘤新突變和致癌基因

2015-03-29 來(lái)源:健客網(wǎng)社區  標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:為了鑒別出肝母細胞瘤的新突變,研究人員對6對肝母細胞瘤及匹配淋巴細胞進(jìn)行了全外顯子組測序。由此鑒別出了21個(gè)基因上的24種體細胞非同義突變,其中大多數的為新發(fā)突變,包括Wnt信號通路中CTNNB1 (G512V)和CAPRIN2 (R968H/S969C)基因的三個(gè)新突變。

  來(lái)自上海交通大學(xué)、復旦大學(xué)和第二軍醫大學(xué)的研究人員,采用外顯子組測序方法揭示出了肝母細胞瘤(hepatoblastoma)的一些新突變和癌基因,并證實(shí)它們與Wnt信號通路以及泛素連接酶復合體相關(guān)。這一研究發(fā)現已在國際著(zhù)名肝臟疾病雜志Hepatology(最新影響因子12.003)在線(xiàn)發(fā)表。

  上海交通大學(xué)的何祥火(Xianghuo He)教授、復旦大學(xué)的董巋然(Kuiran Dong)教授以及第二軍醫大學(xué)的王紅陽(yáng)(Hongyang Wang)院士是這篇論文的共同通訊作者。

  為了鑒別出肝母細胞瘤的新突變,研究人員對6對肝母細胞瘤及匹配淋巴細胞進(jìn)行了全外顯子組測序。由此鑒別出了21個(gè)基因上的24種體細胞非同義突變,其中大多數的為新發(fā)突變,包括Wnt信號通路中CTNNB1 (G512V)和CAPRIN2 (R968H/S969C)基因的三個(gè)新突變。還發(fā)現了從前證實(shí)與泛素連接酶復合體相關(guān)的一些基因:SPOP、KLHL22、TRPC4AP和RNF169。

  研究人員證實(shí),在功能上CTNNB1 (G512V)和CAPRIN2 (R968H/S969C)均為功能獲得性突變,在肝母細胞瘤中CAPRIN2 (R968H/S969C)激活了Wnt信號通路。這些研究結果表明在肝母細胞瘤中存在Wnt信號通路激活,通過(guò)在42個(gè)肝母細胞瘤腫瘤中對β-catenin進(jìn)行免疫組化染色進(jìn)一步證實(shí)了這一點(diǎn)。

  隨后,他們利用shRNA介導RNA干擾,評估了21種突變基因對于肝母細胞瘤細胞生存的影響。研究結果表明1種新的癌基因CAPRIN2和3種抑癌基因SPOP、OR5I1及CDC20B影響了肝母細胞瘤的細胞生長(cháng)。并且,研究人員發(fā)現在肝母細胞瘤細胞中SPOP S119N是一種功能喪失性突變。他們最終證實(shí)SPOP可通過(guò)調控CDKN2B表達抑制肝母細胞瘤的細胞增殖。這些研究結果擴展了肝母細胞瘤的遺傳變異圖譜,闡明了Wnt和泛素信號通路調控異常在肝母細胞瘤的腫瘤形成中起著(zhù)重要的作用。

  外顯子組測序 (Exome sequencing)是近年發(fā)展起來(lái)的一種利用序列捕獲技術(shù)將全基因組外顯子區域DNA捕捉并富集后進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法。是一種選擇基因組的編碼序列的高效策略,相對于基因組測序其成本較低。目前,外顯子組測序已經(jīng)在米勒綜合癥、歌舞伎綜合癥、重型顱腦畸形等孟德?tīng)柤膊〉难芯恐械玫匠晒?。還有其它一些癌癥和復雜性疾病也應用外顯子組測序觀(guān)察到高度相關(guān)的突變。

  文章中外顯子測序、SNP芯片以及后續的大部分數據分析均由晶能生物完成。

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