科學(xué)家們首次完成了對腸癌細胞中許多蛋白質(zhì)的詳細研究。來(lái)自WellcomeTrustSangerInstitute的科學(xué)家調查了蛋白質(zhì)在預測常見(jiàn)突變如何影響癌細胞中蛋白質(zhì)的作用以及這些蛋白質(zhì)在預測癌癥對治療反應方面的重要作用。
結果，今天（8月29日）在“細胞報告”中發(fā)表，使科學(xué)家們更好地了解腸癌后的細胞過(guò)程，并且可以使研究人員能夠預測哪些藥物可以有效治療不同的腸癌患者。
每天有110人被診斷患有腸癌。每年有大約4100例新病例，是英國第四大癌癥。
為了了解癌癥的生物學(xué)基礎，科學(xué)家傳統上研究了所有的癌癥基因-癌癥中的基因組和所有RNA-轉錄組。然而，研究中的盲點(diǎn)一直是研究所有的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)組-它是蛋白質(zhì)，它們是細胞機械的基礎。
在新研究中，科學(xué)家對腸癌中的蛋白質(zhì)進(jìn)行了深入細致的研究，以研究蛋白質(zhì)在預測不同藥物對癌癥的作用方面發(fā)揮的作用。研究人員分析了50種腸癌細胞系中的9,000種蛋白質(zhì)。
來(lái)自WellcomeTrustSanger研究所和倫敦癌癥研究所的主要作者JyotiChoudhary博士說(shuō)：“這項研究是結腸直腸癌細胞系的第一次詳細表征，重要的是將蛋白質(zhì)組學(xué)納入癌癥研究中，因為蛋白質(zhì)是已知蛋白質(zhì)組合和功能的獨特信息，過(guò)去的基因組和轉錄組研究已被證明是癌癥研究中的一個(gè)盲點(diǎn)-但現在包括蛋白質(zhì)組，我們有全貌。”
該團隊能夠構建促進(jìn)腸癌的蛋白質(zhì)協(xié)調網(wǎng)絡(luò )。研究人員使用CRISPR-Cas9來(lái)破壞或敲除編碼關(guān)鍵蛋白質(zhì)的單一基因，并觀(guān)察其網(wǎng)絡(luò )中蛋白質(zhì)的影響。
威康信托桑格研究所的第一作者TheodorosRoumeliotis博士說(shuō)：“我們發(fā)現，沉默一個(gè)基因會(huì )對網(wǎng)絡(luò )的其余部分產(chǎn)生影響，減少了其他蛋白質(zhì)的數量，就像一個(gè)漣漪效應一樣，我們已經(jīng)確定了蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò )可以用于腸癌藥物，我們只能通過(guò)研究蛋白質(zhì)組來(lái)發(fā)現。”
在研究中，該小組在50個(gè)腸癌細胞系中測試了265種現有的抗癌藥物。以前已經(jīng)將基因組和轉錄組的細節用于預測哪些藥物在特定癌癥病例中起作用，但是某些藥物的活性無(wú)法預測。
通過(guò)研究蛋白質(zhì)組，該團隊可以預測未被基因組學(xué)或轉錄組學(xué)解釋的藥物反應。
WellcomeTrustSanger研究所的資深作者UltanMcDermott博士說(shuō)：“這項研究對腸癌患者有希望，它證實(shí)這種常見(jiàn)的癌癥實(shí)際上由五種不同的亞型組成，可能需要不同的藥物治療，令人驚訝的是，蛋白質(zhì)可能比我們以前認為的更容易預測藥物敏感性，未來(lái)我們可能需要測試患者的基因組，轉錄組和蛋白質(zhì)組，以充分預測其對癌癥藥物的反應，并更有效地分層患者進(jìn)行臨床試驗。一切都適合個(gè)性化醫學(xué)。”
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