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提前6至10年預測白血??!科學(xué)家首次構建出預測急性髓細胞性白血病的模型

2018-07-29 來(lái)源:奇點(diǎn)網(wǎng)   標簽: 掌上醫生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:白血病首次被報告是在1827年,但像許多癌癥一樣,多年來(lái)一直病因不清。直到一百多年后的1960年,著(zhù)名的費城染色體被發(fā)現,才把白血病和遺傳物質(zhì)改變聯(lián)系到了一起。之后,更多跟白血病有關(guān)的基因突變也陸續被發(fā)現。

“我們終于找到一種方法,可以在健康人群中找到那些有可能在若干年后(6.3年)得急性髓細胞性白血?。ˋML)的人”,桑格研究所的GeorgeVassiliou博士說(shuō),“我們希望在這個(gè)研究的基礎上,開(kāi)發(fā)出更加可靠的篩查方法,預防白血病的發(fā)生。”[1]

本月初,來(lái)自法國瑪格麗特公主醫院、英國桑格研究所和世界衛生組織國際癌癥研究署的聯(lián)合團隊,與康奈爾大學(xué)醫學(xué)院的研究團隊,分別在頂級期刊《自然》[2]和《自然醫學(xué)》[3]上發(fā)表重要研究成果,基于基因檢測技術(shù),他們開(kāi)發(fā)出首個(gè)AML預測模型,可以提前6-10年找到患AML風(fēng)險高的人群。

這個(gè)新方法,有望幫助醫生提前干預疾病的進(jìn)展,預防AML的發(fā)生。也為其他癌癥開(kāi)發(fā)新的篩查方法提供了思路。

篩查對于癌癥的預防和治療實(shí)在是太重要了。

今年年初,美國發(fā)布的癌癥數據顯示:美國癌癥死亡率繼續保持下降態(tài)勢,其中從2006年到2015年的10年間,癌癥死亡率平均每年下降1.5%,整體下降15%[4]。

死亡率持續下降的背后,接受癌癥篩查的人口比例不斷提高是重要原因之一。

白血病首次被報告是在1827年,但像許多癌癥一樣,多年來(lái)一直病因不清。直到一百多年后的1960年,著(zhù)名的費城染色體被發(fā)現,才把白血病和遺傳物質(zhì)改變聯(lián)系到了一起。之后,更多跟白血病有關(guān)的基因突變也陸續被發(fā)現。

明確白血病與基因突變之間的關(guān)系,一方面可以對疾病更加精確地分型,讓不同類(lèi)型的患者接受精準治療,比如最近火了一把的格列衛;另一方面,也可以對白血病的發(fā)病過(guò)程進(jìn)行深入的探索,使早期發(fā)現白血病成為可能。

急性髓性白血?。ˋML)是成人中最常見(jiàn)的白血病,發(fā)病率隨年齡增加而增加,起病急,且毫無(wú)征兆。54%的成年AML患者是65歲以上的老人,大約1/3年齡超過(guò)75歲。這些65歲以上的AML患者生存期中位數僅7.4個(gè)月,5年生存率只有10%[5]。

因此開(kāi)發(fā)一款可以提前預測AML發(fā)病風(fēng)險的方法顯得格外重要。

LiranI.Shlush、GeorgeS.Vassiliou、PaulBrennan、Johne.Dick和MoritzGerstung等75位科學(xué)家想解決這一難題。

其實(shí)他們的思路很簡(jiǎn)潔。

現在我們都知道癌癥是一種基因病,由于需要不斷的積累基因突變,所以發(fā)病時(shí)間很長(cháng)。即使是名字里帶有“急性”二字的AML,其實(shí)也不例外。

所以,如果我們能拿到一個(gè)患者在發(fā)病之前若干年的血樣,和正常的人血液樣本做個(gè)比較,或許根據這些基因的變異情況,就有可能找到預測一個(gè)人患AML風(fēng)險的方法了。

道理確實(shí)很簡(jiǎn)單。

不過(guò),他們遇到的第一個(gè)問(wèn)題是AML比較罕見(jiàn),每10萬(wàn)人中,只有幾個(gè)患者。怎么去找足夠的患者就是個(gè)問(wèn)題,更困難的是,你還得找那種保存有發(fā)病之前好幾年血樣的患者。

看到這里,你大概明白了,這個(gè)研究為什么有這么多研究單位和科學(xué)家參與。

幸好,這個(gè)世界上有個(gè)叫歐洲癌癥和營(yíng)養前瞻性調查(EPIC)的大隊列。

EPIC是一項旨在調查飲食、營(yíng)養狀況、生活方式和環(huán)境因素與癌癥和其他慢性疾病的發(fā)病率之間關(guān)系的大型隊列研究。EPIC覆蓋了歐洲10個(gè)國家中超過(guò)50萬(wàn)人,隨訪(fǎng)時(shí)間超過(guò)15年,正好可以從中找出AML患者和他們發(fā)病前的樣品。

真是踏破鐵鞋無(wú)覓處,得來(lái)全不費工夫,第一個(gè)問(wèn)題就這樣輕松解決了。

接下來(lái),研究團隊從EPIC中調取了509名志愿者的資料和樣品,其中有95人后來(lái)確診了AML。研究人員拿到了他們在確診前平均6.3年前留存的血樣,通過(guò)深度測序技術(shù)檢測了110個(gè)跟白血病有關(guān)的基因突變。然后量化分析了這些基因突變對最終發(fā)展成AML的相對貢獻。

他們發(fā)現,DNMT3A和TET2這兩個(gè)基因變異在發(fā)病組和對照組之間沒(méi)有太大差異。說(shuō)明,它們對AML的進(jìn)展幾乎沒(méi)有貢獻。而TP53和U2AF1變異,簡(jiǎn)直是危險分子,它們分別可以使未來(lái)10年內的AML風(fēng)險增加12.5倍和7.9倍。

有了這些數據,接下來(lái),研究人員就建立了一個(gè)預測AML的模型。他們選取了其中幾個(gè)對AML貢獻大的基因,通過(guò)分析這些基因的突變等位基因頻率以及突變負荷,同時(shí)參考性別、取血時(shí)年齡,建立了一個(gè)預測模型。

預測模型的效果如何?研究人員又從EPIC中找出291人(其中29人確診AML)設置了一個(gè)驗證隊列。預測模型經(jīng)受住了考驗,靈敏度達到了41.9%,特異性則有95.7%。

研究做到這里啊,實(shí)際上已經(jīng)是很大的進(jìn)步了。

文章的共同第一作者GraceCollord博士也表示:“AML和它的名字一樣,通常發(fā)病很急,雖然我們知道這個(gè)病應該是在患者體內潛伏很久了,但能夠在發(fā)病前6年發(fā)現重要驅動(dòng)性基因突變還是第一次。這就意味著(zhù),我們有可能開(kāi)發(fā)一種方法,識別出AML的高風(fēng)險人群。”

盡管如此,研究人員認為這個(gè)還是不夠的。主要還是因為這個(gè)病在人群中發(fā)病率比較低,只要篩查手法的特異性稍低,就會(huì )出現很多誤報。這不僅會(huì )增加患者的醫療負擔,還會(huì )增加他們的心理負擔。因此,有必要進(jìn)一步提升篩查模型的靈敏性。

如何提高呢?這時(shí)候這個(gè)多元化團隊的力量就凸顯了。

既然基因信息已經(jīng)被利用上了,JohnDick帶領(lǐng)的團隊就想著(zhù)去分析下其他的常規臨床數據。

于是,研究人員分析了37名“前白血病患者”和262個(gè)健康人的血常規和生化檢查數據,發(fā)現了一個(gè)與白血病發(fā)病率關(guān)系密切的指標——紅細胞分布寬度(RDW)升高。

這讓研究人員如獲至寶。

為了驗證RDW的有效性,以及是否還存在類(lèi)似的指標。他們在一個(gè)有345萬(wàn)人15年病例數據的數據庫中做了驗證和分析。發(fā)現RDW升高確確實(shí)實(shí)是AML的風(fēng)險因素,除了RDW之外,單核細胞、血小板、紅細胞和白細胞計數的減少也跟AML有一定的相關(guān)性。

基于上面的血液常規數據,他們用機器學(xué)習算法又開(kāi)發(fā)了一套預測模型。他們發(fā)現,這個(gè)不參考基因變異的模型,可以提前6-12個(gè)月預測AML的發(fā)生,靈敏度達到了25.7%,特異性則有98.2%。

雖然效果不如基于基因變異開(kāi)發(fā)的模型好,但是研究人員表示,這兩個(gè)方法目前單獨使用的話(huà),肯定是不夠準確的。

不過(guò)他們這項工作,第一次讓血液癌癥也有了可以提前預測的希望。后面的工作他們是希望能將這兩個(gè)模型整合起來(lái)使用,理論上效果會(huì )更好(這個(gè)結果估計要留著(zhù)再發(fā)一篇大文章了)。

一旦有一個(gè)準確的早篩方法,預防性的干預和治療也就有望變成現實(shí)。

此外,這個(gè)研究的另一個(gè)價(jià)值在于,給其他的腫瘤早篩研究也提供了一個(gè)很好的研究思路。

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