近幾年來(lái),隨著(zhù)精準醫學(xué)概念的推進(jìn),基因檢測技術(shù)當下備受人們的推崇,它就像給人體做了一個(gè)詳細的說(shuō)明書(shū)。然而,由于做基因檢測的實(shí)驗室繁多,關(guān)于基因突變的重新分類(lèi)并沒(méi)有一套完整的系統或規范,不同實(shí)驗室對突變的術(shù)語(yǔ)命名體系也不同,基因檢測領(lǐng)域內部還存在不少問(wèn)題。
日前,美國《紐約時(shí)報》對該話(huà)題進(jìn)行了深入的研究和報道。
報道稱(chēng),基因檢測出來(lái)的結果看似是一錘定音——基因存在突變或不存在,該突變會(huì )增加某疾病風(fēng)險,或不增加。但事實(shí)上,這些發(fā)現并非看上去的那樣簡(jiǎn)單直接,結果也可能會(huì )對病患們造成嚴重影響。
雖然一個(gè)人的基因組不會(huì )怎么變化,但研究中和疾病相關(guān)的某個(gè)DNA片段很多都處于不斷變化之中?;驅W(xué)家和基因測試實(shí)驗室不斷地收到新信息,使得其可以對基因突變進(jìn)行重新評估和分類(lèi)。
因此,今天看起來(lái)可能為良性的突變,明天有可能就會(huì )變得十分兇險,反之亦然。但目前還沒(méi)有一種好的方式令醫生和病患獲得更新后的消息。
這造成的結果便是:你幾年前測試過(guò)的基因,如今可能已完全變成另外一個(gè)結果。當然,這樣的問(wèn)題只影響少數病人,其中大多數有不尋常的基因突變。更為常見(jiàn)的導致疾病的突變——比如那些會(huì )預測你可能患乳腺癌或結腸癌的突變——已經(jīng)被深入地研究過(guò),因此它們的含義通常不需要再質(zhì)疑。
實(shí)驗報告只是一次性結果
據美國《紐約時(shí)報》報道,在最近的一項研究中,一家診斷性公司Myriad遺傳學(xué)公司的研究人員,對過(guò)去2006年至2016年間曾做過(guò)基因測試的145萬(wàn)病人的數據進(jìn)行了重新評估,以查看這些原始報告中的結果是否屬實(shí)。
實(shí)驗室對其中的6萬(wàn)名患者發(fā)布了新的基因測試報告,這意味著(zhù)舊版結果已經(jīng)完全被新數據所取代。但攜帶有被重新分類(lèi)的突變基因的許多病患,仍被蒙在鼓里。美國貝勒醫學(xué)院的臨床遺傳專(zhuān)家莎倫·普隆醫生說(shuō)道,“這個(gè)系統完全是一片混亂。”她說(shuō),現在根本沒(méi)有一套成系統的方式可以告知病人和醫生,以前被認為無(wú)害的突變如今已經(jīng)顯示出有健康危害,或者以前人們認為危險的突變現在證實(shí)其實(shí)是良性的。
“部分實(shí)驗室報告的只是一次性的結果。”得克薩斯州西南醫學(xué)中心癌癥遺傳學(xué)項目主任羅斯醫生(TheodoraRoss)說(shuō)道,“他們不會(huì )再去重新評估10年前的測試結果解釋方式,除非醫生們要求。”但醫生們幾乎不會(huì )過(guò)問(wèn),她補充說(shuō)。
正常情況下,醫生會(huì )要求有嚴重家族病史的人進(jìn)行基因測試,比如心臟病、中風(fēng)或癌癥。病人血液或唾液樣本會(huì )被送到實(shí)驗室,其DNA會(huì )被掃描是否存在異常突變。
實(shí)驗室會(huì )將這些突變與此前科學(xué)研究中所顯示的可能導致疾病的突變進(jìn)行對比。有些病人會(huì )被告知,他們的突變沒(méi)有多大意義。有些病人則會(huì )被告知,某個(gè)可疑基因存在“釋義原因不明的變種”,這意味著(zhù)沒(méi)人知道該怎么辦。
還有部分病人出現看似危險的基因突變,意味著(zhù)有很高風(fēng)險可能患癌、心臟病或其他疾病。對這些病人來(lái)說(shuō),這樣的結果意味著(zhù)需要定期檢測,會(huì )改變生活的一系列決定,包括是否生育等。
混亂的體系,各實(shí)驗室間難以調和
聯(lián)邦政府提供資金支持建立的數據庫ClinVar,可以讓實(shí)驗室之間分享基因突變數據,以及他們認為這些突變的意義。但部分公司,比如Myriad,雖然儲存了關(guān)于基因突變的海量數據,卻并沒(méi)有向ClinVar分享。
而即便是DNA變異的術(shù)語(yǔ),也沒(méi)有被廣泛統一和分享。不同實(shí)驗室有著(zhù)不同的命名體系。比如,ClinVar用這種方式表達其中一個(gè)DNA的變異:NM_004004.5(GJB2):c.101T>C(p.Met34Thr),而另外一家實(shí)驗室則是這樣表達:c.101T>C,p.Met34Thr,GJB2。麻省綜合醫院博德研究所的臨床遺傳學(xué)家HeidiRehm說(shuō)道,病人自己搜索信息時(shí)“會(huì )不知道在ClinVar里輸入何種關(guān)鍵詞”。
除了術(shù)語(yǔ)問(wèn)題外,羅斯醫生稱(chēng),實(shí)驗室之間也存在不可調和的問(wèn)題。比如,當一家大型實(shí)驗室“報告了一種基因突變的重新分類(lèi)方式,而其他實(shí)驗室卻還沒(méi)有,你的家庭成員們在不同實(shí)驗室做了檢測,那么對同一個(gè)病人的數據就會(huì )出現不同的解讀。”羅斯說(shuō)道,“我們該如何解決?又該如何告知病人呢?”
像Myriad這樣的實(shí)驗室,往往會(huì )在突變基因信息被重新分類(lèi)后通知醫生。但即便這樣,醫生也可能不會(huì )聯(lián)系和通知其病人。“我幾年內換了幾個(gè)工作地點(diǎn),而且有些病人已經(jīng)搬走了,”普隆醫生說(shuō),“比如有些病人已經(jīng)不在休斯頓住了,但我卻收到了他們更新后的醫院報告,我也不知道這些病人現在住在哪里。”
部分遺傳學(xué)家稱(chēng),需要得知更新后結果的病人往往是基因突變十分罕見(jiàn)的患者。他們不得不每年聯(lián)系醫生,詢(xún)問(wèn)該突變的基因是否重新分類(lèi)過(guò),以及意味著(zhù)什么。
突變信息的重新分類(lèi),讓他有更多打算
突變信息的重新分類(lèi),并非總是好消息。
達拉斯兒童醫療中心高級診斷實(shí)驗室臨床主任詹森·帕克博士稱(chēng),他曾告訴過(guò)一些患有嚴重癲癇兒童的父母,原本被認為是致病原因的基因突變其實(shí)是一種良性變化。
重新分類(lèi)可能并不會(huì )改變治療,因為即便找到了被認為是導致嚴重癲癇的突變,往往也沒(méi)有具體的治療方式。但父母們認為,知道病因總歸比不知道好。“對這些家庭來(lái)說(shuō),這可能是很大的一個(gè)社會(huì )問(wèn)題。”帕克博士說(shuō),“人們?yōu)槟硞€(gè)特定基因而聚到一起,形成支援小組。但現在他們不再屬于那個(gè)群體。”
但對居住在得克薩斯州的61歲消防員瑞克·蓋瑞森這樣的人來(lái)說(shuō),突變的重新分類(lèi)可謂是一根救命稻草。
幾年前,他因為鼻子上長(cháng)了一個(gè)疣而去看病,但一家病理實(shí)驗室在檢查該組織后注意到,他體內和林奇綜合征(Lynchsyndrome)相關(guān)的蛋白質(zhì)出現異常變化,這種情況會(huì )導致多種癌癥的發(fā)生率陡增。他后來(lái)去羅斯博士及其遺傳學(xué)團隊那看病,后者將其血液樣本送去做林奇基因突變檢查。結果是:蓋瑞森的基因存在“釋義原因不明的變種”,而他的診斷也令人困惑:“類(lèi)似林奇綜合征。”這意味著(zhù)他得的有可能是這種病,也有可能不是。
醫生建議稱(chēng),他應當每年都做結腸鏡檢查、內窺鏡檢查以及全身皮膚檢查。但因為他的這種突變并非確定與林奇綜合征有關(guān),因此他的家人——他有5個(gè)孩子,都不用去做檢測以查看自己是否遺傳該疾病。
然而今年6月,實(shí)驗室再次聯(lián)系羅斯醫生,告知蓋瑞森的這種突變不再被劃分為“釋義原因不明的變異”,對其他病人的研究證實(shí),該突變的確和林奇綜合征有關(guān)。一切都變了,他的孩子及直系親屬也必須做基因檢測,他該被定期監測各種癌癥跡象。他原本計劃明年退休,但計劃必須變了,因為他擔心自己若罹患得林奇綜合征,健康保險成本太高。他會(huì )繼續做好這份有保險的消防工作,等到65歲再退休,屆時(shí)可拿到美國國家老年人醫療保險。
“我或許最終還是會(huì )因為癌癥而死。”蓋瑞森說(shuō),“但因為這些檢測,我可能還能多活幾年。”
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